化脓性肉芽肿与尖锐湿疣的主要鉴别要点在于前者大多单发，损害多呈短棒状，表面光滑，随着病程延长损害无明显继续增大，醋酸试验阴性，HPV检查阴性，组织病理见相当数量新生毛细血管形成的球状肿块嵌于表皮下基质内;后者大多为多发，损害呈菜花状，随着病程延长损害迅速增大，醋酸试验阳性，HPV检查阳性，组织病理见诊断性凹空细胞等。